这一站接着上一站讲完五阴之后，把同样的问题推到六入上。开头一句“云何六入本如来藏妙真如性”，与上一站问五阴的句式完全一致，显然是把同一套辨析方法推广到六根。六入指眼耳鼻舌身意六根，称“入”是因为根能摄入尘境。佛陀先立一个总纲：六根与疲劳所生的幻相，同是菩提瞪发劳相——意思是见闻觉知的功能以及它显现出来的种种幻象，都是觉性中一念妄动所成的劳相，并非实有自体。
随后逐一辨析六入。以眼入为例：因明暗二种妄尘，发见居中，吸此尘象，名为见性。但这个见性离开明暗二尘，毕竟无体。然后从四个方向推求它的来处：若从明来，暗即随灭，应非见暗；若从暗来，明即随灭，应无见明；若从根生，必无明暗，见精本无自性；若于空出，前瞩尘象归当见根，又空自观何关汝入。四方都推不通，所以知眼入虚妄，本非因缘非自然性。耳入对动静二尘，鼻入对通塞二尘，舌入对甜苦淡二尘，身入对离合违顺二尘，意入对寤寐生灭二尘，破法完全一样，只是换了所对的尘境。每一入都先立一个比喻——手指塞耳、急畜其鼻、舌舐吻、冷手触热手、劳倦则眠——点明根与劳同是菩提劳相，然后说离尘无体，再从尘、根、空三处推求皆不可得，最后结为虚妄。
这里反复出现的“虚妄”，不是说没有见闻觉知这回事，而是说能知与所知都找不到实有的来处，它们的体性就是如来藏妙真如性。破虚妄不是为了否定，而是为了显真。每一段结尾都落在“本非因缘、非自然性”，既否定了因缘和合而生，也否定了自然本有，两边都不成立，剩下的就是如来藏妙真如性。
本站后半段转入十二处。十二处是六根加六尘，共十二个处所。这一站实际讲了色、声、香、味、触五处。每一处都问同一个问题：这尘相是根生出来的，还是尘生出来的？以色处为例：是色生眼见，还是眼生色相？若眼生色相，见空非色时色性应销；若色生眼见，观空非色时见即销亡。两边都说不通，所以见与色空俱无处所。声处问声来耳边还是耳往声处，用钟鼓齐鸣、众人同闻来破单来单往——若声来耳边，则目连迦叶不应俱闻；若耳往声处，钟声齐出则不应俱闻。香处问香生栴檀木、生鼻还是生空，用一铢香四十里同闻来破。味处问味生舌、生食还是生空。触处问能触在手还是在头。每一处都逐层推破，最后结为虚妄，本非因缘非自然性。
这一站讲到触处时，原文在“若各各有，则汝阿难应有二身”处截断，没有像前几处那样给出完整的结论句。触处的结论和意处——也就是法尘——的辨析，应该留在下一站。十二处之后还有十八界，那是下一站要处理的问题。整个脉络很清楚：五阴、六入、十二处，一层一层扩展开来，用同一套破法，把凡夫执着的根尘识都拆开来看，最后都归到如来藏妙真如性上。